万方查重是指利用万方数据库进行文献查重，主要用于检测学术论文中的重复内容，确保学术作品的原创性和学术诚信。万方查重通过比对论文与万方数据库中的文献，找出相似度较高的内容，帮助作者及时修改和完善论文，避免抄袭和学术不端行为。而学术不端查重则是指针对学术不端行为（如抄袭、篡改等）进行查重，旨在维护学术界的诚信和学术规范，保障学术环境的健康发展。两者的区别在于万方查重侧重于文献查重，而学术不端查重关注学术不端行为的检测与防范。

在学术研究中，万方查重与学术不端查重都扮演着重要的角色。万方查重主要服务于学术论文的撰写和审核阶段，帮助作者规避抄袭风险，提升论文质量；而学术不端查重则更多地关注学术道德和学术规范的维护，对于学术不端行为的查处和预防具有重要意义。总的来说，万方查重注重于文献查重技术的应用，而学术不端查重则更侧重于学术道德和学术规范的维护，两者共同促进了学术界的健康发展。