知网查重主要是指利用知网等学术论文查重平台来检测论文中是否存在抄袭现象，帮助作者提高论文质量。而学术不端查重则是指针对学术不端行为进行查重，包括但不限于抄袭、篡改等。知网查重更侧重于学术论文的原创性检测，而学术不端查重则更广泛地涵盖了学术不端行为的检测。

此外，知网查重通常是由作者自行进行，用于确保论文通过学术期刊的审稿要求；而学术不端查重则更多由学术机构或期刊编辑部进行，用于维护学术诚信和学术界的良好秩序。因此，了解知网查重和学术不端查重的区别，有助于学者们规范学术行为，提高论文质量。