学术不端高校毕业论文查重的原因主要包括：1.防止学术不端行为，维护学术诚信；2.检测论文是否存在抄袭和剽窃现象，确保学术作品的原创性；3.提高学生的学术规范意识，促进学术交流与创新。

此外，学术不端高校毕业论文查重还可以帮助学生提升论文写作能力，培养批判性思维和独立研究能力。通过查重过程，学生可以及时发现和纠正论文中存在的问题，提高学术水平和独立思考能力。